Белок нередко можно обнаружить в моче, особенно в разгаре болезни, цилиндры же встречаются уже вначале. Количество мочи уменьшено, удельный вес 1,010—1,015. Реакции на индикан и диазо-реакции положительны. Многие авторы (Балашов, Рабинович, Пятаков) чрезвычайно часто находили диазо-реакцию у сыпнотифозных, а Рабинович и Скородумов — также уробилин и уробилиноген.
В лихорадочном периоде в организме происходит резкая задержка воды (Висковский), которая выравнивается только после падения температуры. Олигургия сменяется диурезами на 4 и, 8-й 12 день. Wiener предложил цветную реакцию с мочей при сыпном тифе, считая ее патогномоничной. Она производится следующим образом: 4 куб см. свежей мочи смешиваются с 4 куб, см. эфира, 1—2 раза встряхиваются. 3 капли краски Jenner'а (Мау-Grunwald) смешиваются с 2 куб. см. воды и 10 каплями 1% марганцевого кали, 1—2 раза встряхивают. Обе жидкости смешиваются так, чтобы моча была в нижнем слое. Моча окрашивается в интенсивно зеленый цвет при положительной реакции и в синий — при отрицательной. Реакция по Wiener'у получается уже со второго дня болезни, при понижении температуры она слабеет, при нормальной отрицательна. По С. Л. Эрлиху, эта реакция есть цветное видоизменение урохромогенной реакции Weiss'а и имеет только относительное значение для распознавания сыпного тифа. С этим мнением согласны большинство авторов (Лауэр и др.), почему эта реакция имеет только исторический интерес.
В тяжелых случаях наблюдается паренхиматозный нефрит, могущий служить причиной смерти.